• 産総研・バイオメディシナル情報研究センター(BIRC)
  H-InvDB Rel. 7.5

• FTPサイト, (Rel. 7.5)
• HTTPサイト, (Rel. 7.5)

• 「創薬研究における統合データベースの活用」20120120＠大阪

• [12-DEC-11] データベース講習会＠大阪　開催のお知らせ
  平成23年度　第2回データベース講習会　「創薬研究における統合データベースの活用」行います。
  日時：2012年1月20日(金）13：00-17：15（開場：12：30）
  会場：産総研・関西センター高分子化学実験棟2107・第7会議室
  申し込み・プログラム詳細（http://hinv.jp/lecture_20120120.html）.
  
  
• [12-DEC-11] ４省の生命科学系データベース合同ポータルサイトintegbio.jpを開設 New!!
  科学技術振興機構（ＪＳＴ）、医薬基盤研究所（ＮＩＢＩＯ）、農業生物資源研究所（ＮＩＡＳ）、 産業技術総合研究所（ＡＩＳＴ）は、内閣府総合科学技術会議の議論を受けて平成２３年１２月１２日（月） に文部科学省、厚生労働省、農林水産省、経済産業省が取り組む生命科学系データベースの 統合化の方針や成果を紹介する合同ポータルサイト「ｉｎｔｅｇｂｉｏ．ｊｐ」（インテグバイオ）を共同で開設しました。
  URL: http://integbio.jp/ja/
  プレスリリース: [産総研/主な研究成果 2011/12/12掲載]
  
  
• [08-DEC-11] 第34回日本分子生物学会(MBSJ2011)での発表 New!!
  H-InvDBおよびMEDALSの口頭・ポスター発表を行います
  (12月13日-16日、パシフィコ横浜)
  また、展示ホール・バイオデータベースコーナーの４省連携コーナーでデモを行います。
  詳細: http://h-invitational.jp/mbsj2011.html
  
  
• [26-SEP-11] BioJapan2011出展
  産総研ブース（B413）：H-InvDBおよびMEDALSに関する展示とデモを行います。
  日時：10月5日（水）～7日（金）
  会場：パシフィコ横浜（横浜）・産総研ブースB413
  URL: BioJapan2011 - World Business Forum -
  URL: 産総研　出展特設ページ
  
  
• [08-SEP-11] シンポジウム『トーゴーの日シンポジウム２０１１』共催
  ～ライフサイエンス分野のデータベース統合の“カタチ”を探る～
  日時：平成２３年１０月５日（水） 午前１０時～午後５時４０分（午前９時３０分開場）
  会場：日本科学未来館　７階 みらいＣＡＮホール
  URL: プログラム・申し込み
  URL: 産総研・イベント
  URL: プレスリリース
  
  
• [22-JUN-11] 第１０回国際バイオEXPO バイオアカデミックフォーラム出展
  講演「ヒト遺伝子統合データベースH-InvDBを用いた発見的データマイニング」(6月30日（木）14：50-15：20 [ACA3])　
  ポスター展示ブース(No.L-11)：H-InvDBおよびMEDALSに関する展示とデモを行います。
  日時：6月29日(水)-7月1日（金)
  会場：東京ビックサイト
  URL: 第１０回国際バイオEXPO バイオアカデミックフォーラム
  URL: 産総研　出展特設ページ
  
  
• [15-APR-11] データベース講習会＠お台場　開催のお知らせ
  平成23年度　第1回データベース講習会　「創薬研究における統合データベースの活用」行います。
  日時：2011年5月19日(木）10：00-17：00（開場：9：30）
  会場：産業技術総合研究所 臨海副都心センター（東京都江東区青海）
  申し込み・プログラム詳細（http://hinv.jp/lecture_20110519.html）.
  
  
• [10-SEP-10] ヒト全遺伝子アノテーションデータベース 「H-InvDB 7.5」をリリース
  リリース7.5では主に下記のものが新しくなりました。
  - 予測遺伝子の選定条件の改良によるヒト遺伝子の再定義
  - ヒト転写産物HIT　242,813件, ヒト遺伝子座HIX　44,806件
  - 242,813 human transcripts in 44,806 human gene clusters (loci).
  - スプライシング判定条件（RASV）の改良、H-DBAS更新
  - タンパク質間相互作用（PPI）データ更新、 PPI view更新
  - サブデータベース更新：ゲノムブラウザ(G-integra)、疾患(DiseaseInfo Viewer)、発現(H-ANGEL)更新
  
  
• [24-MAY-10] 横断検索公開ニュース
  経済産業省・文部科学省関連の生命科学系データベースの横断検索が可能に
  －　省別にまとめられていた「統合データベースプロジェクト」の統合がより進む　－
  詳細はこちら：
  AISTプレスリリース
  MEDALS横断検索公開ニュース
  URL: 生命科学系データベース横断検索
  URL: MEDALS横断検索
  
  
• [14-JAN-10] HEATシステムの更新
  機能を大幅に更新しました。GOやKEGG pathwayなど8種類のア ノテーションに加え、新たにJASPARデータベースに基づくプロモータ領域の共 通モチーフを発見できるようになりました。また、対応IDが増え、ダウンロー ド機能がつくなど、より使いやすくなりました。ぜひHEATをご利用ください。
  URL: http://hinv.jp/HEAT/
  
  

主要論文:

1. H-InvDB in 2009: extended database and data mining resources for human genes and transcripts. Yamasaki C, et al. (2010) Nucleic Acids Research Jan;38(Database issue):D626-32.
2. The H-Invitational Database (H-InvDB), a comprehensive annotation resource for human genes and transcripts. Yamasaki C, et al. (2008) Nucleic Acids Research 36, Database issue D793-D799.
3. Integrative Annotation of 21,037 Human Genes Validated by Full-Length cDNA Clones. T. Imanishi et al. (2004) PLoS Biology 2 (6), 856-875.

関連論文：

1. VarySysDB: a human genetic polymorphism database based on all H-InvDB transcripts. Shimada MK, et al. (2008) Nucleic Acids Research 37(Database issue):D810-5
2. Distribution and effects of nonsense polymorphisms in human genes. Yamaguchi-Kabata Y, et al. (2008) PLOS One2008;3(10):e3393
3. Low conservation and species-specific evolution of alternative splicing in humans and mice: comparative genomics analysis using well-annotated full-length cDNAs Takeda J, et al. (2008) Nucleic Acids Research2008 Nov;36(20):6386-95.
4. Diversity of preferred nucleotide sequences around the translation initiation codon in eukaryote genomes. Nakagawa S, et al. (2008) Nucleic Acids Research
5. Evola: Ortholog database of all human genes in H-InvDB with manual curation of phylogenetic trees. Matsuya A, et al. (2008) Nucleic Acids Research 36, Database issue D787-D792.
6. Mapping of chimpanzee full-length cDNAs onto the human genome unveils large potential divergence of the transcriptome. Sakate R, et al. (2007) Gene 399(1): 1-10.
7. Frequent emergence and functional resurrection of processed pseudogenes in the human and mouse genomes. Sakai H, et al. (2007) Gene 389(2) 196-203.
8. H-DBAS: Alternative splicing database of completely sequenced and manually annotated full-length cDNAs based on H-Invitational. Takeda, J. et al. (2007) Nucleic Acids Research 35, Database issue D104-D109.
9. Large-scale identification and characterization of alternative splicing variants of human gene transcripts using 56 419 completely sequenced and manually annotated full-length cDNAs. Takeda, J. et al. (2006) Nucleic Acids Research 34 (14), 3917-3928.
10. Alternative splicing in human transcriptome: Functional and structural influence on proteins. Yura, K. et al. (2006) Gene 380 (2), 63-71.
11. TACT: Transcriptome Auto-annotation Conducting Tool of H-InvDB, Yamasaki C. et al. (2006) Nucleic Acids Research 34 Web Server issue W345-W349.
12. Investigation of protein functions through data-mining on integrated human transcriptome database, H-Invitational Database (H-InvDB). Yamasaki C. et al. (2005) Gene 364, 99-107.
13. A web tool for comparative genomics: G-compass. Fujii Y. et al.(2005) Gene 364, 45-52.
14. Comparative genomics of bidirectional gene pairs and its implications for the evolution of a transcriptional regulation system. Koyanagi K.O. et al. (2005) Gene 353 (2), 169-176.
15. Large-scale analysis of human alternative protein isoforms: pattern classification and correlation with subcellular localization signals M. Nakao et al. (2005) Nucleic Acids Research 33 (8), 2355-2363.
16. The Human Anatomic Gene Expression Library (H-ANGEL), the H-Inv integrative display of human gene expression across disparate technologies and platforms. M. Tanino et al. (2005) Nucleic Acids Research 33 Database issue, D567-D572.